Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC24A3Q9HC58 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms