Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms