Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms