Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf72Q96LT7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms