Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM9

C20orf173, Uncharacterized protein C20orf173, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf173Q96LM9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
C20orf173Q96LM9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
C20orf173Q96LM9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms