Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REPS1Q96D71 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms