Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRT35Q92764 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms