Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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USP43Q70EL4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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