Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PRAMEF20Q5VT98 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PRAMEF20Q5VT98 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PRAMEF20Q5VT98 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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