Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIF1Q5UIP0 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms