Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms