Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRNQ16849 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms