Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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HIF1AQ16665 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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