Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms