Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZIC1Q15915 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZIC1Q15915 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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