Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ITSN1Q15811 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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