Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPEGQ15772 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms