Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RYR3Q15413 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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