Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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