Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC3Q14574 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC3Q14574 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms