Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM29Q14134 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms