Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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