Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms