Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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