Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNTN1Q12860 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN1Q12860 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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