Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SREBF2Q12772 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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