Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYBPC1Q00872 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms