Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IRX1P78414 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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