Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
RPS29P62273 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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