Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARCN1P48444 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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