Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA13P31271 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXA13P31271 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms