Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCSK1P29120 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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