Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PLNP26678 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PLNP26678 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms