Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms