Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC9A1P19634 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms