Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB6P18564 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms