Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms