Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAPBO95292 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms