Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS4O43181 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms