Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms