Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms