Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms