Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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