Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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