Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms