Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms