Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SEC22CQ9BRL7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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