Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms