Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC10A4Q96EP9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC10A4Q96EP9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms