Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms